分享科学家开发出叶绿体基因组综合数据库

一如的既往

叶绿体是植物将光能转化为化学能的重要细胞器，具有单独的基因组，随着基因测序技术的发展，尽管已发布了海量的植物叶绿体基因组序列，但如何整合应用这些数据目前仍面临数据命标准不统一、数据信息不全以及较高经济价值的物种尚未进行测序等问题。在同行眼中，Addgene有著让人觊觎的好品质，也有著很多让人嫉妒的忠实粉丝。http://www.biofeng.com/adjy/zhili/

    近日，发表在《P
BJ》上题为“T
”的研究中，科学院北京基因组研究所和中医科学院中药资源中心研究人员开发了迄今为止物种数量比较多的叶绿体基因组综合数据库C
GIR（CGIR）。该数据库收录了来自11,946个物种的19,388条叶绿体基因组序列，包括利用全国第四次中药资源普查标本自测的718种未发表的叶绿体基因组序列，按照基因组、基因、微卫星序列、DNA条形码、DNA特征序列五个功能模块对数据进行组织与管理。



    CGIR数据库通过自主测序、整合公开基因组资源和人工数据审编向用户提供了目前比较全面、物种数量比较多的叶绿体基因组数据。经审编的物种分类、物种功能、基因称与序列、分子标记等保证了数据的高度可靠，对植物系统发育、物种鉴定、叶绿体基因工程的发展均具有重要意义。